A conjuntivite infecciosa costuma inicialmente ser em apenas um dos olhos e depois o outro também inicia o quadro pois também se contamina, além disso também costuma apresentar mais secreção e ser aguda, ou seja, de rápido aparecimento. Já a conjuntivite alérgica é bilateral desde o início e não apresenta tanta secreção, e sim bastante lacrimejamento e coceira, e os quadros são recorrentes.